Đầu tháng 4, miền Bắc đón đợt nắng nóng đầu tiên của mùa hè 2021, tuy nhiên khu vực Hà Nội và các tỉnh phía Đông chịu tác động của một hình thế khác là rãnh thấp trong đới gió Tây di chuyển từ phía Tây sang tạo nên tình trạng nhiều mây và ngăn cản đà tăng nhiệt của Hà Nội cũng như các tỉnh phía Đông. Sau đó, rãnh thấp này sẽ trôi về phía biển Đông, nền nhiệt khu vực Bắc Bộ sẽ tăng nhanh. Nền nhiệt của Hà Nội sẽ ở mức 34 - 35 độ C hoặc cao hơn. Đây là đợt nắng nóng đầu tiên của mùa hè này, nhưng trong tháng 4/2021 vẫn còn những đợt không khí lạnh yếu.
Không khí lạnh trong các đợt giao mùa cộng với tác động của hình thái thời tiết rãnh thấp phía Tây sẽ tạo nên các đợt mưa đá mạnh. Khoảng từ ngày 4 - 6/4 sẽ có một đợt không khí lạnh tác động yếu, cùng lúc hình thái thời tiết rãnh thấp phía Tây sang sẽ gây ra đợt mưa rào và giông diện rộng ở Bắc Bộ. Ở khu vực Tây Bắc, vùng núi Bắc Bộ sẽ có khả năng xảy ra các hiện tượng thời tiết cực đoan như giông, lốc, mưa đá, sấm sét mạnh.
Năm 2021, Việt Nam chịu ảnh hưởng của hiện tượng La Nina (La Nina), nên xu hướng nhiệt trong các tháng chính hè (từ tháng 5 - 8/2021) ở mức xấp xỉ trung bình nhiều năm cùng thời kỳ và có 1 vài thời điểm thấp hơn. Với xu hướng như vậy, nắng nóng mùa hè năm 2021 tại Bắc Bộ và Trung Bộ sẽ không gay gắt như nắng nóng năm 2020.
Dự báo, nắng nóng ở Nam Bộ sẽ kéo dài đến khoảng giữa tháng 4/2021. Sang tháng 5/2021 là tháng mưa tại Nam Bộ sẽ làm giảm tình trạng xâm nhập mặn ở khu vực này. Tuy nhiên, xâm nhập mặn ở các sông Vàm Cỏ tiếp tục tăng cao trong các đợt từ 11 - 14/4, 24 - 30/4; trên sông Cái Lớn tăng cao trong các đợt từ 30/3 - 7/4, 15 - 24/4. Từ tháng 5/2021, xâm nhập mặn tại Đồng bằng sông Cửu Long giảm dần.
Trung Bộ, Tây Nguyên và Nam Bộ từ nay đến tháng 6/2021 xâm nhập mặn giảm dần, dòng chảy phần lớn trên các sông ở Trung Bộ và khu vực Tây Nguyên phổ biến ở mức xấp xỉ và thấp hơn trung bình nhiều năm cùng thời kỳ từ 20 - 50%, một số sông thấp hơn 60%.
Trong tháng 4/2021 và tháng 5/2021, nguy cơ xảy ra khô hạn, thiếu nước cục bộ tại các tỉnh Nghệ An, Phú Yên, Ninh Thuận, Bình Thuận và khu vực Tây Nguyên, sau đó mở rộng ra các tỉnh khác ở Trung Bộ.