Cụ thể, công ty này kê khai thiếu doanh thu không chịu thuế, khấu trừ thuế giá trị gia tăng mua vào của hàng hóa dịch vụ của đơn vị bỏ địa chỉ kinh doanh nhưng chưa hoàn thành thủ tục đóng mã số thuế. Ngoài ra, Hải Phát bị phạt tiếp 2,1 triệu đồng do chưa kê khải doanh thu tính thuế Thu nhập doanh nghiệp với các căn hộ thuộc dự án gắn với bất động sản đã đủ kiện bàn giao.
Mặc dù, lợi nhuận trước thuế năm 2019 của Hải Phát đạt 632,5 tỷ đồng, tăng 5,7% so với năm 2018. Nhưng công ty này vẫn còn thiếu hơn 1,4 tỷ đồng tiền thuế, chậm nộp, bị Cục Thuế Hà Nội nhắc nhở, yêu cầu Hải Phát phải tự tính và nộp đủ.